表觀遺傳觀點及其在肝細胞癌切除後早期復發中的預後價值

背景/目標

肝細胞癌（HCC）患者在肝切除手術後的生存面臨挑戰，主要是因為復發率高，特別是早期復發（ER）。我們研究了 HCC 的 DNA 甲基化，並開發了一種基於甲基化的早期復發預測模型（MER）。

方法

我們研究了肝細胞癌（HCC）患者，將術後一年內發生早期復發（ER）的患者與術後五年內無復發（RF）的患者進行比較。在測試組中，我們分析了全基因組甲基化特徵，以識別 ER 和 RF 之間的差異。之後在獨立的世代研究中，使用即時定量甲基化特異性PCR（qMSP）來驗證候選基因標記。我們藉由整合已識別的基因甲基化、臨床資訊以及血清蛋白標記來構建MER，並使用ROC分析與Cox 回歸評估其預測效能。

結果

在ER與RF之間，以及在肝硬化與非肝硬化組別之間，觀察到明顯高度甲基化與低度甲基化之特徵。於非肝硬化ER患者中，發現顯著異常的甲基化途徑，包括FGFR訊號傳導、PI3K網絡及MAPK路徑。相反地，肝硬化ER患者則顯現出與Wnt / β-catenin訊號傳導、細胞黏附及遷移機制的顯著關聯。透過qMSP分析，我們鑑定出與ER相關的基因，包括BDNF、FOXL2、LMO7、NCAM1、NEIS3、PLA2G7和LTB4R。MER展現出對ER的強大預測能力，AUC達到0.855，超越現有指標，如：AFP、腫瘤大小和BCLC分期。結合不同的預測因子後，AUC 值還能進一步提升。值得注意的是：加入MER後，AUC高達0.952，突顯了MER對預測準確性的重大貢獻。

結論

本研究發現：異常DNA甲基化在具有早期復發（ER）的肝細胞癌（HCC）中扮演重要的角色。MER的表現優於臨床病理學預測因子，並展現出強大的預測能力，可有效識別具有ER風險的患者。

03-04-2025 updated.